Analysis of Gene Expression Data: Applications to Studies of Cancer, Differentiation and Stem Cells

Analysis of Gene Expression Data: Applications to Studies of Cancer, Differentiation and Stem Cells

DNA chips are novel experimental tools that have revolutionized research in molecular biology and generated considerable excitement. A single chip allows simultaneous measurement of the level at which thousands of genes are expressed. A typical experiment uses 50 – 100 of such chips, each focusing on one sample – such as material extracted from a particular tumor. Hence the results of such an experiment contain several hundred thousand numbers, that come in the form of a table, of several thousand rows (one for each gene) and 50 – 100 columns (one for each sample). We developed various methodologies to mine and analyze such data. This talk will provide a basic introduction; I will explain briefly how gene expression is measured by DNA chips, review some methods of analysis and present results obtained from analysis of data from studies of (a) translocations and leukemia and (b) the differentiation process, from stem cells to adult tissue. Depuis les premières mesures des fluctuations de température du fond diffus cosmologique en 1992, le spectre de puissance semble présenter un déficit à grande échelle. Cet effet, statistiquement peu significatif lors des observations de l’époque, a récemment été confirmé par les mesures du satellite WMAP. Il ságit dúne des seules anomalies (en tout cas dúne des seules surprises) de ces nouvelles données. Ces dernières ont en effet conforté de façon très convaincante le modèle désormais ßtandard » de la formation des structures, fondé sur une phase initiale dínflation dún univers aujourd’hui dominé par une matière et une énergie sombres, dont la nature reste pour l’heure inconnue.

Bien quíl ný ait pas encore dáccord sur le sens réel de ce manque de fluctuations à grande échelle, une pléthore déxplications a déjà été proposée, dont la plus satisfaisante (ou la moins invraisemblable) est une topologie multiconnexe des sections spatiales de lúnivers. Plus précisément, alors quún certain nombre de topologies sont trivialement exclues, dáutres comme celle de léspace dodécaédrique de Poincaré sájustent très bien aux données. Je présenterai les prédictions de ces modèles ainsi que leur statut à la lumière des dernières analyses des données du satellite WMAP. Les partons durs traversant un milieu dense subissent de fortes pertes d’énergie. La distribution de probabilité de ces pertes d’énergie – essentielle pour la phénoménologie des collisions nucléaires de haute énergie – sera calculée dans une première partie. Ceci me permettra ensuite de déterminer látténuation des jets en diffusion profondément inélastique ainsi que dans les réactions díons lourds. Lóbjectif est de donner une introduction à la biologie moléculaire, en montrant en particulier límportance des idées issues de la physique pour la compréhension du vivant.

Weizmann Institute of Science, Israël

L'événement est terminé.

Date

17 novembre 2003
Expiré!

Heure

14h15 – 0h00

Lieu

Salle Claude Itzykson, Bât. 774
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